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引言

仅仅通过观察单一浓度的放射性配体的结合不能确定结合速率常数。配体达到平衡的速率不仅取决于结合速率常数和配体浓度,还取决于解离常数。

确定结合速率常数的一种方法是全局拟合使用两种不同浓度的放射性配体获得的数据。这里介绍的另一种方法是在一个实验中测量结合和解离。

添加放射性配体并测量多个时间点的总结合,然后在时间0开始解离(通过添加拮抗剂或大量稀释),然后在不同时间测量解离。

循序渐进

创建一张XY数据表。将时间以分钟为单位输入到X,将总结合输入到Y

从特异性结合表中,单击“分析”,选择“非线性回归”,选择“动力学结合方程”窗格,然后选择结合然后解离。

将HotNM([放射性配体(nM)]和Time0(解离开始时间)约束为常数值。如果在“Y”列中输入特异性结合,也请将NS限制为常数值零。

模型

Radioligand=HotNM*1e-9

Kob=[radioligand]*Kon+Koff

Kd=Koff/Kon

Eq=Bmax*radioligand/(radioligand + Kd)

Association=Eq*(1-exp(-1*Kob*X))

YatTime0=Eq*(1-exp(-1 * Kob *Time0))

Dissociation=YatTime0* exp(-1 * Koff *(X-Time0))

Y=IF(X<Time0,Association,Dissociation)+NS

 

解读参数

Koff是解离常数(分钟)-1

Kon 是以分钟倒数为单位的结合常数乘以浓度倒数。

KD 由Koff/Kon计算得出。单位为摩尔。

Bmax是与放射性配体最大浓度平衡时的最大结合,单位为Y轴单位。除非使用非常高浓度的放射性配体,否则Bmax将有一个很宽的置信区间,因为该实验不是为确定Bmax而设计。

NS是以Y轴为单位的非特异性结合,其为时间0时的Y值,也是在所有配体解离后很久的Y值。

注释

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