方差分析和重复测量方差分析

对于多数多重比较检验，第一步是用下面的公式计算两个均值之差的标准误差，其中 n1 和 n2 是被比较的两个均值的样本量，MSerror 是方差分析表中适当的均方值。

对于无重复测量的单因素方差分析或双因素方差分析，方差分析表中只有一个 MSerror（或 MSresidual）。对于有重复测量方差分析的双向方差分析，具体使用哪个 MS 值，请参阅本文档。

通过先计算集合标准偏差，上述等式可以简化一些：

请注意，MS 误差（和集合标准偏差）是根据所有组的所有数据计算得出的。如果样本量相等，则所有两对均值之间差异的 SE 将相同。

重复测量方差分析后的多重比较。

拟合混合效应模型后的多重比较

对于重复测量数据，Prism 可以让您进行重复测量方差分析或拟合混合效应模型。在没有缺失值的情况下，两者是等价的。如果存在缺失值，则无法进行重复测量方差分析，但仍可以拟合混合效应模型。

对于多重比较，差异标准误差的计算公式为 sqrt(L*C*L')，其中 L 是对比向量/矩阵， C 是拟合优度值的方差-协方差矩阵。