P值回答了什么问题？

Fisher检验或卡方检验得出的P值回答了以下问题：

如果总体中定义行（行变量）的变量与定义列（列变量）的变量之间确实不存在关联，那么通过随机抽样得到与本实验中观察到的关联强度相当（或更强）的关联，其概率是多少？

当存在两列且行数超过两行，且数据按自然顺序排列时，会进行趋势卡方检验。该方法也被称为科克伦-阿米蒂奇法。P值回答了以下问题：

如果行号与左列中受试者的比例之间不存在线性趋势，那么通过随机抽样偶然观察到如此强烈的趋势的概率是多少？

有关趋势卡方检验的更多信息，请参阅 D. G. Altman 所著的优秀教材《医学研究实用统计学》（Practical Statistics for Medical Research），该书由查普曼与霍尔出版社于 1991 年出版。

请记住，“统计学显著”并不等同于“科学上重要”。

根据P值的大小不同，您对结果的解释也会有所不同。

为什么P值并不总是与置信区间一致？

P 值与置信区间是相互关联的。如果 P 值小于 0.05，那么 95% 置信区间就不能包含定义零假设的值。（对于 P 值 < 0.01 和 99% 置信区间等情况，也可以制定类似的规则。）

但在Prism软件处理的列联表结果中，这条规则并不总是成立。

通过Fisher检验计算出的 P 值完全正确。然而，优势比和相对风险的置信区间是通过仅近似正确的方法计算得出的。因此，置信区间可能与 P 值并不完全一致。

例如，结果可能显示 P<0.05，但相对风险的 95% 置信区间却包含 1.0。（相对风险为 1.0 意味着没有风险，因此定义了零假设）。 同样地，也可能出现 P>0.05，但 95% 置信区间不包含 1.0 的情况。

这些看似矛盾的情况很少发生，且通常出现在您输入的某个数值等于零时。

P值的计算方法

卡方检验的计算方法是标准流程，所有统计学书籍中都有详细说明。

Fisher检验被称为“精确”检验，因此您可能会认为关于如何计算 P 值应该存在共识。事实并非如此！

虽然大家对如何计算单尾P值意见一致，但实际上，从Fisher检验中计算“精确”的双尾P值有三种方法。Prism采用“小P值求和法”来计算双尾P值。 大多数统计学家似乎都推荐这种方法，但有些软件却采用不同的方法。

若想深入了解，SISA 提供了一份附有参考文献的详细讨论。另请参阅艾伦·阿格雷斯蒂（Alan Agresti）所著《分类数据分析》（Categorical Data Analysis）中关于 Fisher检验的章节。这是一个非常令人困惑的话题，这也解释了为何不同的统计学家（以及不同的软件公司）会采用不同的方法。

单侧 P 值

Prism 允许您选择报告单侧或双侧 P 值。

在卡方检验中，单侧P值等于双侧P值的一半。 ***指出（第503页，第5版），存在一种极其罕见的情况，此时单侧P值可能会产生误导：如果您的实验设计同时选择了行总和与列总和。

为什么我们使用“单侧”而不是“单尾”这一术语？是为了避免混淆。 卡方检验值总是正数。为了从卡方检验值中求得P值，Prism会计算（在零假设下）观察到该卡方检验值或更大卡方检验值的概率。因此，它只考虑卡方检验分布的右尾部分。 但当偏离零假设的方向不限（比例之间的正负差，相对风险大于或小于1）时，卡方检验值仍可能很高。因此，双侧P值实际上是根据卡方检验分布的一侧计算得出的。  

在Fisher检验中，单侧P值的定义是明确无误的。但在大多数情况下，单侧P值并不等于双侧P值的一半。