什么是火山图？

当您运行多个 t 检验时，Prism（从第 8 版开始）会自动生成所谓的火山图。

每个点代表数据表中的一行。

X 轴绘制的是均值之间的差异。在 X=0 处显示一条虚线网格线，表示无差异。

Y 轴上绘制的值依赖于您的选择。

•如果您选择了不进行多重比较校正的统计学显著方法，则火山图中的 Y 轴值为 P 值的对数乘以负一。因此，如果 P 值为 0.01，则其对数（以 10 为底）为 -2，Y 轴上绘制的值为 2.0。

•如果您选择了对多重比较进行校正的统计显著性方法，则 Y 轴值为多重性校正后 P 值的对数（取负值）。

•若采用FDR方法，Y轴则绘制q比值的负对数。

 

注释

•所有对数均为以10为底的对数。

•如果您使用统计学显著方法，Prism 会自动在 X=0（无差异）处绘制一条网格线，并在 Y= -log(alpha) 处绘制一条网格线；如果您选择 FDR 方法，则在 Y= -log(Q) 处绘制一条网格线。

•火山图会自动生成，Prism 不提供不生成该图的选项。但删除它非常简单。

•您经常会看到 X 轴为两个均值之比的火山图。但 t 检验关注的是差异，而非比值。如果您关注比值，请考虑将所有值转换为对数，然后运行多重 t 检验分析。这利用了两个对数值之间的差等于其比值的对数这一事实。

•维基百科上关于火山图的文章将为您提供更多相关知识。