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1.创建数据表

从“欢迎使用”或“新建表格”对话框中,选择创建XY数据表,选择使用教程数据,并从Pharamcology教程列表中选择样本数据“剂量-反应-模糊直至约束”。请注意,该选项位于样本数据集的下拉菜单中。

2.检查数据表

X值为摩尔浓度的对数。Y值为反应,输入为平均值和标准差。使用Prism,可输入复制值或输入在其他位置计算的误差值(此处为SD)。

 

3.查看图表

由于这是您首次查看图表,因此Prism将弹出“更改图表类型”对话框。选择第一个选项,绘制平均值和误差条,并选择您偏好的误差条类型。

4.选择“非线性回归”

点击 并从XY分析列表中进行选择。

甚至更快,点击非线性回归的快捷按钮。

5.选择一个模型

在“非线性回归”对话框的“拟合”选项卡上,打开“刺激剂量反应方程”窗格,并选择:log(激动剂)与反应的关系-可变斜率。

了解有关 拟合剂量反应曲线的更多信息

6.选择检测“模糊”的模型拟合

在“非线性回归”对话框的“置信度”选项卡上,确保选择了“识别“模糊”拟合”选项(这是默认选项,但不是数据不完全拟合模型时,Prism提供的唯一检测方法)。

在本示例中,将所有其他设置保留为默认值。

点击“确定”查看叠加在该图表上的曲线。

7.检查图表

曲线很好地通过了该点,看起来很好。

8.检查结果

转至结果页面,查看结果。

请注意结果顶部的“模糊”一词。这意味着Prism无法找到这些数据的唯一匹配。许多参数值集将会得出能同样很好拟合的曲线。了解有关 模糊拟合的更多信息

Prism没有报告logEC50或曲线底部的置信区间,而是简单地表示区间“非常宽”。这告诉您不可能精确拟合这些参数。

数据的Y值约100-约600时,曲线底部的最佳拟合值为-1067。此外,logEC50的最佳拟合值超出了数据范围。

即使曲线靠近点(R² 为0.9669),最佳拟合参数值也是无用的。

9.约束曲线的底部

问题很简单。已要求Prism为代表曲线底部和顶部稳定段以及中点和陡度的四项参数找到最佳拟合值。但数据并未定义曲线的底部。事实上,Prism拟合的底部最佳拟合值离数据非常非常远。

计算这些数据,以减去基础非特异性反应。这意味着您知道在非常低的激动剂浓度(非常低的X值)下的反应(Y)必须为零。Prism需要知道这一点,以便合理拟合数据。

无需再次拟合,改为点击结果表左上角按钮,返回“非线性回归”对话框。

转至“约束”选项卡,选中“约束参数底部”,使其具有一个常量值,并将其设置为0.0。

10.检查修改后的结果

现在结果有了意义。logEC50在X值范围的中间。置信区间相当小。当然,结果不再“模糊”。

 

 

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