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示例:全局非线性回归(剂量-反应曲线)

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1.创建数据表

从“欢迎”或“新建表格”对话框中,选择创建XY数据表,选择使用教程数据,并在药理学教程集中选择样本数据“剂量-反应:通过全局拟合的EC50偏移”。

2.检查数据

解释如何拟合数据的浮动注释框(适用于未阅读该帮助页面的人员)可能会部分覆盖样本数据。您可移开浮动注释框或将其最小化。

X值是激动剂浓度对数。注意“1e- 9”与0.000000001完全相同。如需以对数形式输入,请输入“-9”。

在两种情况下,Y值是反应(一式两份)。

3.查看图表

由于这是您首次查看图表,因此Prism将弹出“更改图表类型”对话框。选择第一个选项以绘制平均值和误差条,并选择“SD误差条”。

4.选择“非线性回归”

点击 并从XY分析列表中选择“非线性回归”。

或者,点击非线性回归的快捷按钮。

5.选择一个模型

在“非线性回归”对话框的“拟合”选项卡上,跳转至“剂量 - 反应 - 刺激模型”,并选择“对数(激动剂)与反应 - 变量斜率”。

现在,将所有其他设置保留为默认值。

点击“确定”查看叠加在该图表上的曲线。

6.检查结果

对照结果标记模糊。这意味着Prism无法通过该数据找到唯一的曲线。许多其他参数值集将会得出能同样很好拟合的曲线。通过查看95%置信区间,您可发现参数模糊。Prism并未报告区间,而是报告底部和logEC50“非常大”。

这些数据并未就对照(圆形)数据集定义底部平稳段,因此其最佳拟合值模糊。EC50是在曲线底部和顶部平稳段之间得出一半反应的浓度。如果底部模糊,则EC50也如此。

处理后的曲线未标记“模糊”,但置信区间比您想要的区间更大。

7.返回该对话框并共享三项参数

如果您愿意假设顶部和底部平稳段以及斜率在对照和处理条件下相同,则您可从该数据集得出更好结果。换而言之,您假设治疗更改了EC50,但并未改变基础反应、最大反应或斜坡斜率。

点击结果表左上方的按钮,返回“非线性回归”对话框。

跳转至“限制条件”选项卡,并选择共享“底部”、“顶部”和“斜坡斜率”的值。您共享这些参数时,Prism会对数据集进行全局拟合,为(这两个数据集的)底部、顶部和斜坡斜率的值找到一个最佳拟合值,并为logEC50分离出最佳拟合值。

8.查看修改后的图表和结果

 

拟合不再标记“模糊”,置信区间更窄。

9.在统计上比较两个logEC50的值

返回非线性回归的“参数”对话框,并跳转至“比较”选项卡。查看选项,以检验一条曲线是否充分拟合所有数据集。

Prism现在将通过两种方式拟合数据。第一个与先前相同,为各数据集拟合一个独立IC50。第二个拟合共享所有参数。在该案例中,已共享三项参数,但还有一项参数并未共享。因此在第二次拟合中,共享所有四项参数,故Prism通过所有数据拟合一条曲线,忽略其所属治疗组。Prism利用额外的平方和F检验来比较平方和(实际上是平方和,因为在各案例中均有两个数据集拟合)。结果显示在结果工作表顶部。

P值较小,因此我们拒绝两个IC50值在人群中相同的零假设,而是得出两个IC50值不同的结论。

10.直接拟合两个IC50值的比值

根据步骤8的结果,您可计算出您想要了解的内容 - 两个EC50值的比值。

但Prism可直接计算该值。

返回“分析参数”对话框,并在“拟合”选项卡上将方程从“剂量-反应-特殊”方程组更改为“EC50偏移”。接受所有默认值,然后点击“确定”。该图表看起来相同,因为模型等效。但现在,Prism并非拟合两个logEC50值,而是拟合一个,还拟合比值。

该方程专为计算该示例所需的数值而设计。阅读 如何构建该方程,以便您可在必要时构建自身方程。

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