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操作指南:曲线下面积

曲线下面积是对可测量效应或现象的一种综合度量。它在药代动力学中用作药物效应的累积度量,在色谱分析中则用作比较峰值的手段。

请注意,Prism 还会作为独立的 ROC 分析的一部分,计算受试者工作特征(ROC)曲线下面积。

从表示曲线的数据表或结果表开始。单击“分析”,然后从 XY 分析列表中选择“曲线下面积”。

解读曲线下面积结果

若您的数据源自色谱或光谱分析,Prism 可将数据划分为独立区域并确定每个区域的最高点(峰值)。但 Prism 仅在区域界限清晰时才能执行此操作:信号(即效应或现象的图形表示)在相邻区域之间必须低于基线,且各峰值不得重叠。

对于每个区域,Prism 会以 X 轴单位乘以 Y 轴单位的形式显示其面积。Prism 还会将每个区域的面积显示为所有区域总面积的百分比。面积计算采用梯形规则,即在定义曲线的每组相邻点之间连接一条直线,并求和这些线段下方区域的面积。

接下来,Prism 会识别每个区域的峰值。该信息以区域内最高点的 X 和 Y 坐标,以及代表区域起始和结束的两个 X 坐标的形式呈现。

Prism 识别出的区域可能超出您的关注范围。此时,请返回“参数”对话框,将区域的最小宽度值和/或峰值的最小高度值调大。

此分析的局限性

请注意以下限制:

基线必须是水平的。

不进行平滑处理或曲线拟合。

Prism 不会分离重叠的峰。除非信号在两个相邻峰之间完全下降至基线,否则程序不会区分这两个相邻峰。同样,Prism 也不会识别位于另一个峰肩部内的峰。

如果信号起始(或结束)于基线之上,则第一个(或最后一个)峰将不完整。Prism 将报告其“观察到”的尾部下面积。

如果您的第一个 X 值大于零,Prism 不会向后外推至 X=0。

Prism 不会将曲线外推至数据集中的最大 X 值之外,因此也不会将曲线外推至基线。

Prism不再强制要求X值等间距分布。在求和梯形面积时,即使某些梯形比其他梯形更宽,结果也是可接受的。

Prism 如何计算曲线下的面积

Prism 使用梯形公式计算曲线下的面积,如下图所示

在 Prism 中,一条曲线(由非线性回归生成)本质上是一系列相互连接的 XY 点,且 X 值间距相等。对于您输入的 XY 表格,Prism 同样可以计算曲线下的面积,且不再强制要求 X 值间距相等。 上图左侧展示了其中两个点,基线以虚线表示。该曲线段下的面积(即梯形)已用阴影标出。图的中间部分展示了 Prism 如何计算该面积。中间面板中的两个三角形面积相等,因此左侧梯形的面积等于右侧矩形的面积(后者更易于计算)。 因此,面积为 ΔX*([(Y1+Y2)/2]-基线]。Prism 会对定义曲线的每对相邻点反复应用此公式。

面积的计算基于您指定的基线以及两个 X 值之间的曲线。哪些 X 值?

如果所有数据点都大于基线,AUC 计算将从数据集中的最小 X 值开始,到最大 X 值结束。请注意,Prism 不会将曲线延伸到数据 X 范围之外。

如果最低 X 值处的 Y 值低于基线:Prism 会找出数据集中与大于基线的 Y 值相关联的最小 X 值。它在该点与数据集中 X 值次小的点之间画一条直线。然后,它使用线性插值法找出该直线与基线的交点,并将该插值结果作为计算 AUC 的第一个 X 值。

如果最大 X 值处的 Y 值低于基线:Prism 会查找数据集中与大于基线的 Y 值关联的最小 X 值。它在该点与数据集中 X 值次小的点之间画一条直线。随后,它使用线性插值法确定该直线与基线的交点,并将该插值结果作为最后一个 X 值来计算 AUC。

AUC的标准误差与置信区间

如果您输入的数据包含重复的 Y 值,或以均值和标准差(SD)或标准误(SEM)形式输入,Prism 将采用 Gagnon (1) 描述的方法,为 AUC 报告标准误(SE)和置信区间。如果您在子列中输入了重复的 Y 值,Prism 会假设这些是同一实验中的重复测量。如果每个子列实际上代表不同的重复实验,Prism 不会为每个子列分别计算 AUC,然后对这些值求平均。 95% 置信区间等于 AUC 加上或减去 1.96 倍的标准误。它采用 z 分布(因此常数为 1.96),而非 t 分布(其值依赖于样本量),因为参考文献 1-3 中使用的是 z 分布。当定义曲线的数据点超过几十个时,t 分布和 z 分布的方法结果几乎无法区分。

Prism 不会通过比较峰值来提供差异的置信区间或相应的 P 值。但通过一些操作,您可以让 Prism 完成此任务:

1.创建一个新的分组表,并设置为输入均值、标准误差和样本量(n)的格式。您只需在该表格的第一行输入数值。

2.将 AUC 值作为均值输入。

3.将 AUC 值的标准误输入为“SEM”。

4.将每个组的自由度定义为该组的数据点数减去浓度数。

5.对于 n,输入比自由度 (df) 多 1 的数值。当 Prism 进行 t 检验时,它会从输入的 n 中减去 1 以获得自由度,此时自由度值即为正确值。

6.点击“分析”,若要比较两个 AUC 值,请选择 t 检验;若要比较三个或更多 AUC 值,请选择单因素方差分析(ANOVA)。

更多细节及完整示例。

什么算作峰?

默认情况下,Prism 仅将高于基线的点视为峰值的一部分,因此仅报告位于基线之上的峰值。您可以选择将低于基线的峰值也纳入考虑范围。

默认情况下,Prism 会忽略高度小于 Y 值最小值到最大值距离 10% 的任何峰值,但您可以在“曲线下面积”参数对话框中更改此定义。您还可以设置忽略非常窄的峰值。

峰值总面积、总面积与净面积

Prism 通过以下两种或三种方式报告峰下的面积:

总面积。该值将正峰、负峰、高度不足以计入的峰以及过窄而无法计入的峰进行求和。在分析对话框中,唯一会影响总面积定义的选项是基线的定义。

总峰面积即您要求 Prism 纳入计算的峰值之和。该值受分析对话框中多项设置的影响:基线定义、是否包含或忽略负峰的选择,以及对过小而无法计数的峰值的定义。

净面积。仅当您要求 Prism 将基线以下的峰值定义为峰值时,才会显示此值。它是通过从基线以上峰值的面积中减去基线以下峰值的面积计算得出的差值。

参考文献

1.Robert C. Gagnon 和 John J. Peterson,《基于破坏性获得的药代动力学数据估算曲线下面积的置信区间》,《药代动力学与药效动力学杂志》,26: 87-102, 1998。

2.Bailer A. J. (1988). 使用破坏性测量技术时曲线下面积相等的检验。《药代动力学与生物药剂学杂志》,16(3):303-309。

3.Jaki T. 和 Wolfsegger M. J. (2009). 完整与不完整采样设计中AUC估计的理论框架。《生物药学研究统计学》,1(2):176-184.