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“多重比较”选项卡:生存分析

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在 Prism 中进行包含两个以上组的 Kaplan-Meier 生存分析时,您可以选择包含多重比较功能,以评估各组之间的两两比较。此功能自 Prism 10.5 起提供,相关选项位于生存分析对话框的“多重比较”选项卡中。

比较次数

通过这些控件,您可以精确指定希望 Prism 执行哪些成对比较。可选选项包括:

•不进行多重比较检验——将不执行任何比较

•将每条生存曲线与其他所有曲线进行比较——此选项将对生存分析中所有可能的组组合执行比较检验。以三个组(A、B 和 C)为例,共有三种可能的比较(A 与 B、A 与 C 以及 B 与 C)。 若有四个组,则有六种组合;若有五个组,则有十种组合,以此类推。

•将每列的生存曲线与对照列的曲线进行比较——此选项将针对单个对照组与其他所有组分别进行比较。比较次数等于组数减一(5个组产生4次比较,3个组产生2次比较,以此类推)。

•比较预选的生存曲线对——此选项允许您指定要进行的具体比较。系统将仅执行这些比较,且在进行多重比较校正时,也仅考虑这些比较。 请如实评估您实际需要进行多少次比较。若在查看数据后才选择特异性比较,您很可能未能恰当地应用修正方法。下一节将对此进行更详细的讨论

您实际进行了多少次比较?

您必须如实评估所进行的比较次数。假设共有四个治疗组(包括对照组 A)。 随后,您回过头来将生存时间最长的组与生存时间最短的组进行比较。若声称您仅进行了一次比较是不恰当的,因为若不查看全部数据,您就无法决定进行哪次比较。在四个组的情况下,您可以进行六组两两比较:

1.A 与 B

2.A 与 C

3.A 与 D

4.B 与 C

5.B 与 D

6.C 与 D

通过观察数据并选取最短和最长的曲线,您实际上已经隐含地进行了所有这些比较,因此必须据此对结果进行适当的校正。

另一方面,如果您在进行实验之前就知道,您只对将三个处理组中的每一个与对照组进行比较感兴趣,而不对处理组之间进行比较,那么您将进行三项比较:

1.A 与 B

2.A 与 C

3.A 与 D

多重比较检验

Prism 提供了三种不同的方法来处理多重比较检验的校正:

1.使用统计假设检验对多重比较进行校正

2.通过控制错误发现率(FDR)对多重比较进行校正

3.不进行多重比较校正。每次比较均独立处理

Prism 的默认设置是使用统计假设检验。

统计假设检验法

该方法首先执行所有指定的比较,并确定各自的 P 值。随后,根据已进行的比较次数及指定的校正方法,对各个 P 值进行调整,以确保家族错误率(α)保持在指定值。 这种校正方法的最终结果是,为了维持指定的α值,调整后的P值会比未经校正的P值更大。Prism为生存分析后的统计假设检验提供了三种用于调整多重比较的校正方法:

1.Holm-Šídák——该检验是 Prism 中生存分析后校正多重比较的默认方法。与其他选项相比,它通常具有更高的功效

2.Bonferroni

3.Šídák

错误发现率法

错误发现率法采用的方法与统计假设检验法不同。它并非通过提高将结果判定为“统计学显著”的阈值(即降低α值或等效地提高单个P值)来实现,而是通过控制假阳性率来实现。 换言之,该方法可确保在被识别为“发现”的结果中,虚假发现的比例低于指定百分比。该百分比称为错误发现率(用 Q 表示),并在进行分析时予以指定。

Prism 提供了三种控制错误发现率的方法。所有方法都会决定将哪些(如有)比较标记为“发现”,并确保错误发现率控制在您指定的值 Q 之下。

1.Benjamini、Krieger 和 Yekutieli 的两阶段递升法(推荐)

2.Benjamini 和 Hochberg 的原始 FDR 方法

3.Benjamini 和 Yekutieli 的修正方法(低功效)

不进行校正

如果您选择此选项,Prism 将仅对指定的每组两两比较分别执行独立的对数秩检验。 任何结果都不会进行校正。选择此方法意味着更可能错误地判定某项比较具有“统计学显著性”。除非有非常充分的理由,否则我们建议不要使用此选项。

多重比较选项

本节允许您指定与所选分析中多重比较校正方法相关的选项。若使用统计假设检验方法对多重比较进行校正,您将可选择为每次比较报告经多重性调整的 P 值。 此外,您还可以为正在进行的一组比较指定整体α阈值。如果您选择不应用任何校正方法,则该α值将适用于每项单独的比较(每组比较将包含单次比较,而非将所有比较视为一组进行整体校正)。

如果您选择使用错误发现率方法进行校正,则可以指定所需的 Q 值。