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在 Prism 中进行涉及两个以上组的 Kaplan-Meier 生存分析时,您可以选择包含多重比较功能,以评估各组之间的两两比较。此功能自 Prism 10.5 起提供,相关选项位于生存分析对话框的“多重比较”选项卡中。

比较次数

通过这些控件,您可以精确指定希望 Prism 执行哪些两两比较。可选选项包括:

不进行多重比较检验 - 不会执行任何比较

将每条生存曲线与其他所有曲线进行比较 - 此选项将对生存分析中所有可能的组组合执行比较检验。若包含三个组(A、B 和 C),则有三种可能的比较(A 与 B、A 与 C 以及 B 与 C);若包含四个组,则有六种组合;若包含五个组,则有十种组合,以此类推。

将每列的生存曲线与对照列的曲线进行比较 - 此选项针对单个对照组与其他所有组分别进行比较。比较次数等于组数减一(5个组产生4次比较,3个组产生2次比较,以此类推)。

比较预选的生存曲线对 - 此选项允许您指定要进行的具体比较。系统将仅执行这些比较,且在应用多重比较校正时也仅考虑这些比较。请如实评估您实际需要进行多少次比较。若在查看数据后才选择特定比较,您很可能未能恰当地应用校正方法。下一节将对此进行更详细的讨论

实际进行了多少次比较?

您必须如实评估所进行的比较次数。假设存在四个治疗组(包括对照组 A)。随后,您回过头来将生存期最长的组与生存期最短的组进行比较。若声称仅进行了一次比较是不恰当的,因为若不查看全部数据,您便无法决定进行哪次比较。在四个组的情况下,您可进行六组两两比较:

1.A 与 B

2.A 与 C

3.A 与 D

4.B 与 C

5.B 与 D

6.C 与 D

通过观察数据并选取最短和最长的曲线,您实际上已经隐含地进行了所有这些比较,因此必须据此对结果进行适当的修正。

另一方面,若您在实验开始前就已明确,您仅关注将三个处理组中的每一个与对照组进行比较,而不关注处理组之间的相互比较,那么您将进行三组比较:

1.A 与 B

2.A 与 C

3.A 与 D

多重比较检验

Prism 提供了三种不同的方法来处理多重比较检验的校正:

1.使用统计假设检验进行多重比较校正

2.通过控制错误发现率 (FDR) 进行多重比较校正

3.不进行多重比较校正。每次比较均独立处理

Prism 的默认设置是使用统计假设检验。

统计假设检验法

该方法首先执行所有指定的比较并确定各自的 P 值。随后,它结合已进行的比较次数与指定的校正方法,对各个 P 值进行调整,以确保整体错误率(α)保持在指定值。 这种校正方法的最终结果是,调整后的 P 值会大于未校正的 P 值,以维持指定的 α 值。Prism 为生存分析后的统计假设检验提供了三种多重比较检验校正方法:

1.Holm-Šídák - 此检验是 Prism 中生存分析后校正多重比较的默认选项。它通常比其他选项具有更高的检验力

2.Bonferroni

3.Šídák

错误发现率法

错误发现率法采用与统计假设检验法不同的方法。它并非通过提高“统计学显著”的判定阈值(即降低α值或等效地提高单个P值)来实现,而是控制假阳性率。 换言之,该方法确保在被识别为“发现”的结果中,虚假发现的比例低于指定阈值。该阈值称为错误发现率(用 Q 表示),并在执行分析时予以指定。

Prism 提供了三种控制错误发现率的方法。所有方法均决定将哪些(如有)比较标记为“发现”,并确保错误发现率控制在您指定的 Q 值以下。

1.Benjamini、Krieger 和 Yekutieli 的两阶段递升法(推荐)

2.Benjamini 和 Hochberg 的原始 FDR 方法

3.Benjamini 和 Yekutieli 的修正方法(低检验力)

不进行校正

若选择此选项,Prism将仅对指定的每组两两比较分别进行独立的对数秩检验。所有结果均不进行校正。选择此方法意味着更可能错误地判定某项比较具有“统计学显著性”。除非有充分理由,否则我们建议不要使用此选项。

多重比较选项

本节允许您指定与所选多重比较校正方法相关的选项。若采用统计假设检验方法进行多重比较校正,您可选择为每次比较报告经多重性校正的 P 值。 此外,您还可以为当前进行的比较族指定整体显著性水平(family-wise alpha)阈值。若选择不应用任何校正方法,该显著性水平将适用于每项单独的比较(即每组比较仅包含单项比较,而非将所有比较视为单一整体)。

若选择采用错误发现率法进行校正,您可指定所需的 Q 值。