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在多变量图表的数据对象中,树状图具有独特性,因为它只能作为层次聚类分析结果的一部分来创建。此外,树状图既可以作为独立的图表呈现,也可以作为对象添加到热图中(该热图由层次聚类分析生成)。 “设置图表格式”对话框中的“树状图选项”页面允许您在这些图表上添加并自定义这些数据对象,其内容和布局将取决于树状图是作为独立图表还是作为热图的附加组件。
所需数据结构
生成树状图(无论是作为独立图表还是热图上的装饰元素)的唯一途径是将其作为层次聚类分析的输出结果之一。您的数据无需遵循特异性数据结构,因为当作为层次聚类分析的输出结果之一被请求时,Prism 会自动生成这些图表。
格式选项(独立树状图)
选项页面顶部的复选框可用于在图表上开启或关闭聚类树。在 macOS 系统中,此控件为切换按钮而非复选框。
分支
树状图选项页的此选项卡允许您自定义树状图分支(线条)的外观。如果您在执行层次聚类分析时未指定聚类数(或切割高度),则只能使用“单色”外观选项。 但是,如果您在分析参数对话框中选择了指定聚类数(或切割高度),则还可以选择外观选项“可变(按聚类)”,这将允许您为生成的聚类树中的每个聚类分配不同的视觉属性。这些属性包括:
•配色方案/颜色 - 选择内置配色方案,根据聚类为分支分配颜色;或选择特定组并分配自定义颜色
•透明度 - 设置聚类图分支的透明度级别
•粗细 - 定义树状图分支的线宽
•样式 - 定义树状图分支所使用的线条图案
•方向 - 指定树状图应采用垂直距离轴和水平标签轴(“垂直”),还是水平距离轴和垂直标签轴(“水平”)
标签
这些选项允许您指定树状图标签轴上标签的外观。标签类型允许您在变量值(默认)、字母(A、B、C…)或数字(1、2、3…)之间进行选择。 “起始于”选项指定将首先显示哪个标签(该标签之前的所有标签都将从图表中省略),而“间隔”选项则指定要显示的标签间隔。例如,假设使用数字作为标签。如果“起始于”选项设置为 4,且“间隔”选项设置为 3,则:
•标签 1、2 和 3 将不会显示
•标签 4 将作为第一个显示的标签
•标签 5 和 6 将不显示
•标签 7 将显示,8 和 9 将不显示
•标签 10 将显示,11 和 12 将不显示……
此外,在此选项卡中,您还可以定义树状图标签的字体以及旋转角度。
距离轴
距离轴有时也被称为“高度”轴,用于显示在层次聚类过程中形成的聚类之间的距离。这些控件允许您指定距离轴的视觉属性,包括:
•坐标轴的颜色
•坐标轴的透明度
•坐标轴的粗细
•坐标轴的线型(图案)
请注意,目前无法调整距离轴的显示范围、刻度间隔或其他属性。
格式选项(作为热图组成部分的树状图)
选项页面顶部的复选框可用于在图表上开启或关闭聚类树。在 macOS 上,此处采用的是切换按钮而非复选框。请注意,切换此选项将启用或禁用图表上的所有聚类树。作为层次聚类分析的一部分,您可以选择对行、列或两者同时进行聚类(从而生成聚类树)。 如果因某种原因您选择了同时对行和列进行聚类,但希望在关联的热图上仅显示其中一种聚类树,请勿使用此主切换按钮。相反,请将相应的下拉菜单(“纵轴”或“横轴”)设置为“无”(更多详情见下文)。
添加到热图中的每个聚类树由其绘制的轴定义:即“纵轴”或“横轴”。这是因为热图本身可以将数据的行映射到横轴或纵轴,数据的列也是如此。 因此,如果数据的行被分配到热图的水平轴上,那么分配到水平轴上的聚类树将对应于对数据行执行的聚类结果。如果在层次聚类分析中未对行或列进行聚类,则相应的聚类树选项将被禁用。
对于每个已执行层次聚类分析的轴,您可以指定该轴上聚类树的一般外观:
•无 - 禁用(或隐藏)此聚类树。请注意,这是在保留其他聚类树的同时仅禁用单个聚类树的方法
•单色 - 允许您为树状图的所有分支指定一组统一的选项(颜色、透明度、粗细、样式)
•可变(按聚类)——此选项允许您针对该聚类树中由层次聚类分析定义的每个聚类,分别指定选项(颜色、透明度、粗细、样式)