隐式方程是指等号两边都出现Y的方程。Prism将(尝试)将由隐式方程定义的模型拟合到您的数据中。
遵循质量作用定律的结合位点在平衡状态下的总结合模型为
Y = NS*X + Bmax*X/(Kd + X)
该模型形式假设 X 是配体的游离浓度。由于 X 实际上是您输入的浓度,因此该模型假设只有极小一部分配体发生结合,所以尽管 X 是您输入的浓度,但它也非常接近游离浓度。
如果大量配体发生结合呢?Prism 内置了一个复杂模型来处理这种情况。但在其他类似情况下,可能尚未推导出相应的模型,或者推导起来非常困难甚至不可能。此时,隐式方程便派上用场了。
在上述情况下,推导隐式方程非常简单。模型中有三个位置出现了 X。您输入的 X 值是配体的总浓度。进入模型的值必须是游离浓度,即总浓度减去结合浓度。假设 X 和 Y 单位相同,我们只需在所有三个位置将 X 替换为 X-Y:
Y = NS*(X-Y) + Bmax*(X-Y)/(Kd + (X-Y))
当您实际拟合数据时,可能需要对方程稍作调整(如下所示),以处理单位转换,从而使 Kd 以 nM 而非 cpm 为单位显示。
在“方程”对话框顶部选择隐式方程类型,并在等号两边都定义 Y。

仅此而已。与任何用户自定义方程一样,您需要定义约束条件和初始值。
•在本示例中,您实际上不会在同一行方程中看到等号两边都有 Y。但第一行将 Y 置于等号右侧,第四行也将其置于右侧。这使得该方程成为隐式方程。
•如果像本示例中那样从 X 中减去 Y,则 X 和 Y 必须使用相同的单位。此处两者均以每分钟放射性计数(cpm)为单位。当然,如果 Y 的单位是 cpm 而 X 的单位是 nM,那么从 X 中减去 Y 就毫无意义。
•Prism 处理隐式方程比普通方程“更困难”。您可能需要反复调整初始值和约束条件才能使其正常运行。计算时间会显著延长,尽管对于小数据集和高性能计算机而言,这种差异可能并不明显。
•在显式方程中,Y 同时出现在等号的两侧,而 X 必须仅出现在等号的右侧。
•在本示例中,显式方程已推导出来,甚至已内置于 Prism 中。您可以下载的文件(下方链接)同时采用两种方法(显式方程和隐式方程)拟合数据,且结果完全一致。在其他情况下,推导显式方程可能很困难甚至无法实现。