隐式方程是指等号两边都出现Y的方程。Prism将(尝试)将由隐式方程定义的模型拟合到您的数据上。
遵循质量作用定律的结合位点在平衡状态下的总结合模型为
Y = NS*X + Bmax*X/(Kd + X)
该模型形式假设 X 是配体的游离浓度。由于 X 实际上是您输入的浓度,因此该模型假设只有极小一部分配体会结合,所以即使 X 是您输入的浓度,它也与游离浓度非常接近。
如果配体的相当大一部分发生了结合,该怎么办?Prism 中内置了一个复杂模型来处理这种情况。但在其他类似情况下,可能尚未推导出相应的模型,或者推导起来非常困难甚至不可能。此时,隐式方程便派上了用场。
在上述情况下,很容易写出一个隐式方程。 模型中有三个地方出现了 X。您输入的 X 值是配体的总浓度。输入到模型中的值必须是游离浓度,即总浓度减去已结合的浓度。假设 X 和 Y 单位相同,我们只需在所有三个地方将 X 替换为 X-Y:
Y = NS*(X-Y) + Bmax*(X-Y)/(Kd + (X-Y))
当您实际进行数据拟合时,可能需要对方程稍作调整(如下所示),以处理单位转换,从而使 Kd 的报告单位为 nM 而不是 cpm。
在“方程”对话框顶部选择“隐式方程”类型,并在等号两边均包含 Y 来定义方程。

就这样。与任何用户自定义方程一样,您需要定义约束条件和初始值。
•在本示例中,您实际上不会在同一行方程中看到等号两边都出现 Y。但第一行将 Y 置于等号右侧,第四行也将其置于等号右侧。这使得该方程成为隐式方程。
•如果像本示例中那样从 X 中减去 Y,则 X 和 Y 必须使用相同的单位。这里两者均以每分钟放射性计数(cpm)为单位。当然,如果 Y 的单位是 cpm 而 X 的单位是 nM,那么从 X 中减去 Y 就毫无意义。
•对于 Prism 而言,拟合隐式方程比拟合普通方程“更难”。您可能需要反复调整初始值和约束条件才能使其正常运行。计算时间会显著延长,尽管对于小数据集和高性能计算机而言,这一差异可能并不明显。
•在显式方程中,Y 会出现在等号的两侧,而 X 必须仅出现在等号的右侧。
•在本示例中,显式方程已经推导出来,甚至被内置到 Prism 中。您可以下载的文件(链接如下)同时采用了两种方法(显式方程和隐式方程)对数据进行拟合,且结果完全一致。在其他情况下,推导出显式方程可能很困难甚至无法实现。