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引言

在高浓度下,某些底物也会抑制酶的活性。已知约20%的酶会发生底物抑制。当两分子底物能够与酶结合,从而阻断其活性时,就会发生底物抑制。

分步操作

创建一个XY数据表。在X列中输入底物浓度,在Y列中输入酶活性。如果有多个实验条件,将第一个条件放在A列,第二个放在B列,依此类推。

输入数据后,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“酶动力学方程”面板,然后选择“底物抑制”。

模型

Y=Vmax*X/(Km + X*(1+X/Ki))

参数

Vmax 是酶的最大反应速率(假设底物未抑制酶活性),其单位应与 Y 相同。

Km 是米氏常数,单位与 X 相同。它描述了在无抑制剂存在时底物与酶之间的交互作用。

Ki 是底物结合的解离常数,表示两个底物可同时结合到一个酶上。其单位与 X 相同。

注:Prism 7及后续版本对初始值的处理规则与Prism 6不同(已得到改进)。

为何该模型不总能收敛到拟合结果

如果将该模型重新排列,则更容易理解其拟合问题:

Y=Vmax/(Km/X + 1 + X/Ki)

Vmax 控制峰值的高度(但不等于峰值处的 Y 值)。

当 X 值较小时,最后一项趋近于零,因此曲线的早期部分(X 值较小)由 Km 的值决定。

反之,当 X 值较大时,第一项趋近于零,因此曲线的后半部分(X 值较高处)由 Ki 的值决定。

曲线的中间部分由 Ki 和 Km 共同决定。  

拟合结果之所以会产生“模糊拟合”的结果,有两个原因。

•X 值范围的数据点不够广泛。需要有小于 Km 且大于 Ki 的 X 值,理想情况下应有大量 X 值。如果您只有曲线中段的数据,那么就根本没有信息可以分别确定 Km 和 Ki。

•虽然曲线的形状看起来像一条底物抑制曲线,但实际上并不完全符合。换句话说,这些数据实际上并不符合底物抑制模型。

参考文献                                                                         

方程5.44,见RA Copeland,《酶》,第2版,Wiley出版社,2000年。