在饱和结合实验中,通过改变放射性配体的浓度并测量结合情况,旨在确定Kd(在平衡状态下结合到一半受体位点的配体浓度)和Bmax(最大结合位点数)。
配体不仅会结合到受体位点,还会结合到非特异性位点。处理非特异性结合主要有三种方法。
•扣除非特异性结合,仅分析特异性结合。
•仅分析总结合量,并根据总结合曲线的形状推断非特异性结合量。当配体结合两个位点时,此方法效果不佳
•同时对总结合和非特异性结合进行全局分析。这是最佳方法,具体细节如下所述。
创建一个 XY 数据表。将放射性配体浓度输入 X 列,总结合输入 Y 列,非特异性结合量输入 B 列。
X轴可使用任意方便的单位。Kd值将以相同的浓度单位显示。总结合与非特异性结合应使用相同的单位。Bmax值将以相同的单位显示。
在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“饱和结合方程”面板,并选择“双结合位点 - 总结合与非特异性结合”。
“背景”参数表示未添加放射性配体时的测得“结合”值,因此代表计数器背景(如有)。建议将其约束为常数零。
Specific1=BmaxHi*X/(X+KdHi)
Specific2=BmaxLo*X/(X+KdLo)
非特异性=NS*X + 背景
<A>Y=Specific1 + Specific2 + Nonspecific
<B>Y=非特异性
<A> 和 <B> 的语法表示:第四行仅用于数据集 A(总结合),而第五行仅用于数据集 B(非特异性)。
参数 NS 和 Background 在两个数据集之间共享。
BmaxHi 和 BmaxLo 是两个位点的最大特异性结合量,单位与 Y 相同。
KdHi 和 KdLo 是平衡解离常数,单位与 X 相同。它是达到平衡时实现半最大结合所需的放射性配体浓度。
NS 是非特异性结合的斜率,单位为 Y 除以 X。
Background 是未添加放射性配体时的非特异性结合量。这代表计数器的背景值。如果您的计数器会自动扣除背景信号,则可将 Background 限定为常数零。