方差分析（ANOVA）与重复测量方差分析

对于大多数多重比较检验，第一步是使用下式计算两个均值之间差异的标准误差，其中 n1 和 n2 分别是待比较的两个均值的样本量，MSerror 是 ANOVA 表中相应的均方值。

对于单因素方差分析或无重复测量的双因素方差分析，方差分析表中仅有一个 MSerror（或 MSresidual）。对于带有重复测量的双因素方差分析，请参阅本文档以了解应使用哪个 MS 值。

通过先计算合并标准偏差，可以稍微简化上述公式：

请注意，MSerror（以及合并标准偏差）是根据所有组中的所有数据计算得出的。如果样本量相等，则均值差的标准误对于所有均值对而言都是相同的。

重复测量方差分析后的多重比较。

拟合混合效应模型后的多重比较

对于重复测量数据，Prism 允许您进行重复测量方差分析或拟合混合效应模型。当没有缺失值时，这两者是等效的。当存在缺失值时，虽然无法进行重复测量方差分析，但仍可拟合混合效应模型。

对于多重比较，差异的标准误差按 sqrt(L*C*L') 计算，其中 L 是对比向量/矩阵，C 是控制数据处的方差-协方差矩阵。