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术语

科普兰建议不要使用这个过于简化的方程。相反,他建议使用我们称为“混合模型抑制”(但他称之为“非竞争性抑制”)的方程。

引言

非竞争性抑制剂可可逆地与酶-底物复合物及酶本身结合。这意味着有效Vmax随抑制作用而降低,但Km值保持不变。可以通过在不同浓度的抑制剂存在下测量底物-速率曲线,来确定竞争性抑制剂的Ki值。

“非竞争性”这一术语的使用并不统一。通常,当抑制剂与游离酶及酶-底物复合物结合的亲和力相同时,该术语按上述定义使用。然而,有时“非竞争性”这一术语的用法更为宽泛,即当两种结合亲和力存在差异时,这种情况通常被称为混合模型抑制。

分步操作

创建一个 XY 数据表。在 X列中输入底物浓度,在 Y 列中输入酶活性。每组数据集(Y 列)代表在不同浓度抑制剂存在下收集的数据,从零开始。将这些浓度输入到列标题中。请确保输入的是浓度,而不是浓度的对数。

输入数据后,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“酶动力学方程”面板,然后选择“非竞争性酶抑制”。

模型

Vmaxinh=Vmax/(1+I/Ki)

Y=Vmaxinh*X/(Km+X)

 

常数 I 代表抑制剂浓度,该值需输入到各列标题中。该参数被限定为数据集常数。

参数 Vmax、Km 和 Ki 是共享的,因此 Prism 会为整个数据集拟合一个控制数据。

参数解读

Vmax 是无抑制剂条件下酶的最大反应速率,其单位与 Y 相同。

Km 是米氏常数(无抑制剂条件下),其单位与 X 相同。它描述了无抑制剂条件下底物与酶的交互作用。

Ki 是抑制常数,其单位与您输入的 I 相同。

如果数据与该模型拟合不佳,请考虑改用竞争性或非竞争性模型进行拟合。或者使用混合模型抑制的更通用方程进行拟合。

 

参考文献                                                                         

方程 3.4 出自:RA Copeland,《药物发现中的酶抑制剂评估》,第二版,Wiley 2013。ISBN:978-1-118-48813-3。