当您在方差分析(ANOVA)后选择“错误发现率(FDR)”方法进行多重比较时,Prism 将执行以下操作:
1.使用未校正的 Fisher 检验执行您请求的比较。这将为每次比较产生一个 P 值。这些 P 值未对多重比较进行校正,并非经多重性校正的 P 值。
2.使用您选择的 FDR 方法(Prism 提供三种变体)来决定哪些 P 值足够小,可被视为“发现”。该计算依赖于您选择的方法以及您设定的 Q 值(即期望的错误发现率,以百分比表示)。
3.对于每次比较,还需计算一个 q 值。每次比较的 q 值各不相同。若您将 Q 值设为此数值(即 Prism 报告的 q 值),则该比较将恰好处于“发现”与否的临界点上。
注:
•当您选择FDR方法时,Prism不会报告任何关于统计学显著性的信息,也不会(无法)报告置信区间或多重性校正后的P值。但它会报告q值,这些值类似于校正后的P值。
•虽然FDR方法常用于处理大量P值(如Prism的多重t检验分析所计算的),但通常不将其用作方差分析(ANOVA)的后续检验。
•变量 q 既是 FDR 多重比较方法结果的一部分,也是 Tukey 和 Dunnett 多重比较检验的一部分。这三种检验对变量 q 的定义不同,因此不应相互比较。