在饱和结合实验中,通过改变放射性配体的浓度,并在达到平衡时测量结合情况。其目的是确定Kd值(即在平衡状态下结合到受体位点一半的配体浓度)和Bmax值(即最大结合位点数)。
配体不仅会结合到受体位点,还会结合到非特异性位点。处理非特异性结合有三种方法。
•扣除非特异性结合,仅分析特异性结合。
•仅分析总结合,并根据总结合曲线的形状推断非特异性结合的量。
•对总结合和非特异性结合进行全局拟合。
我们推荐第三种方法(对总结合与非特异性结合进行全局拟合)。拟合特异性结合的问题在于,为了从总结合中扣除非特异性结合,必须做出某些假设,而由此拟合出的结果并非真实数据。在可能的情况下,我们建议直接拟合实际采集的数据,避免创建衍生数据集(本例中即特异性结合)。
仅拟合总结合曲线所需数据较少,因此可节省实验时间和经费。但大多数人认为,仅凭结合曲线的形状来定义非特异性结合(而未通过实验测定非特异性结合)会令人感到不适。仅拟合总结合曲线的一个优势在于,已有推导出的方程可用于拟合此类数据,即使当相当一部分配体结合导致配体耗尽(游离浓度远低于添加浓度)时亦然。
Prism 提供了单位点和双位点拟合模型。您可通过“比较”选项卡中的选项来对比两种拟合结果。在比较单位点与双位点模型的拟合结果时,请结合常识与统计分析。若其中一个位点仅占总量的极小部分,或其 Kd 值超出实验中放射性配体浓度的范围,则不应采纳双位点模型。