比较族是指为控制错误率而归为一组的比较集合。 所有多重比较校正方法——无论是采用Bonferroni、Tukey和Holm等方法控制家族错误率(FWER),还是控制错误发现率(FDR)——均在家族层面而非单个比较层面进行操作。
显著性阈值α和FDR阈值均适用于整个比较族。对于FWER方法,校正的设计旨在确保:假设比较族中的所有零假设均为真,则在整个比较族中获得哪怕一个虚假显著结果的概率仍保持在α或以下。 对于FDR方法,校正会限制在该组内所有被判定为显著的比较中,假阳性结果的预期比例。在这两种情况下,组都界定了控制错误率的范围。
每个家族中的比较次数越多,校正就越严格,检测真实差异的功效就越低。每个家族中的比较次数越少,校正就越宽松,功效就越高,但代价是每个单独家族内的假阳性风险会增加。
在某些分析中,Prism 允许您选择家族的定义方式。例如,在双向方差分析中,您可以将每行定义为一个家族,这样既能保持每个家族规模较小,又能确保比较具有较高的功效。或者,您也可以将所有行中的比较合并为一个大型家族,以进行更保守的分析。 正确的选择依赖于您的实验设计和科学问题。
当一个家族中仅包含一项比较时,Prism 不会提供校正方法。这并非软件的局限性,而是统计学上正确的处理方式。
校正方法旨在解决因在同一家族内同时进行多重比较而导致的假阳性风险上升问题。当一个家族中仅有一项比较时,不存在此类风险上升的情况。 根据定义,单次比较的错误率等于族状错误率,因为该家族中仅需考虑一次比较。应用校正不会改变 P 值,因此未经校正的 P 值既是单次比较的结果,也是族状结果。
因此,当Prism检测到一个家族中仅包含一次比较时,它会将“不进行校正”作为唯一选项,并直接报告未经校正的P值。这并非分析力度减弱,而是针对该家族结构的恰当结果。
如果 Prism 未提供校正方法,说明它已检测到您定义的一个或多个组中仅包含一项比较。这种情况最常发生在定义的组数等于或超过比较总数时,导致每个组最多只需对一项比较进行校正。
请检查“多重比较”选项卡中的“多少个组?”设置。请考虑是否通过定义数量较少但规模较大的组,更能准确反映您的实验设计。将比较分组为较少的组会增加每个组的比较数量,此时校正方法便会变得可用。
如果您是故意将每个比较族定义为仅包含一项比较,则无需采取任何操作。未校正的 P 值即为该分析的正确且完整的结果。
要了解处理多重比较的三种通用方法,请参阅《处理多重比较的三种方法》。关于在双因素双向方差分析中具体如何定义组,请参阅《多重比较》选项卡:双向方差分析。