Prism 提供的后续多重比较检验因您使用的方差分析(ANOVA)类型而异,因此针对单因素方差分析、双因素方差分析和三因素方差分析分别提供了独立的操作指南。请注意,多重比较选项位于每个方差分析对话框的两个选项卡中:
•“多重比较”选项卡用于设定您的目标,且不同类型的方差分析在此处的设置方式差异较大。
•“选项”选项卡用于选择要使用的检验方法,这三种 ANOVA 的选项较为相似,本页提供适用于所有三种 ANOVA 的概览。
三种方差分析对话框的“选项”标签页均提供三个主要选项,对应下文所述的三个标题,并在其中包含更多具体选项。
Prism 提供的多重比较选项取决于以下三个问题:
•您的目标。您希望进行哪些比较?请根据您的实验目标,在单因素方差分析对话框的“多重比较”选项卡中回答此问题。
•是否要在结果中包含置信区间?并非所有多重比较检验都能计算置信区间。请在单因素方差分析对话框的“选项”选项卡中回答此问题,这属于个人偏好,与特定实验设计并无直接关联。
•非参数?
目标 |
是否同时报告置信区间和显著性? |
方法 |
将每个均值与其他所有均值进行比较 |
是 |
Tukey(推荐) |
否 |
Holm-Sidak(首选) |
|
将每个均值与对照组均值进行比较 |
是 |
|
否 |
||
比较选定的均值对(最多 40 对) |
是 |
|
否 |
||
存在线性趋势吗?列均值与列序有关吗? |
否 |
线性趋势检验。仅在单因素方差分析中可用。 |
若进行单因素方差分析且选择不假设所有总体方差相等,Prism 将执行替代形式的方差分析,以及相应的替代性多重比较检验。
Prism 提供了三种控制错误发现率的方法。所有方法都会决定将哪些(如有)比较标记为“发现”,并确保错误发现率控制在您输入的阈值 Q 以下。
当您选择控制错误发现率时,Prism 会首先为每个比较计算精确P值。对于常规方差分析,它使用Fisher LSD 法;对于非参数方差分析,它使用Dunn法(不进行多重比较校正);对于单因素方差分析,它使用韦尔奇 t 检验。 随后,它将利用这组 P 值,结合您选择的错误发现率控制方法,报告哪些比较结果足够显著(即哪些 P 值足够小),从而被标记为“发现”。
对于常规(参数)方差分析,Prism 使用 Fisher LSD 检验计算这些 P 值。对于不假设方差相等的单因素方差分析,则改用韦尔奇 t 检验计算 P 值。
对于非参数方差分析,Prism 使用未经校正的 Dunn 检验,该方法不进行多重性校正。
这些未考虑多重比较的 P 值将小于经多重比较校正后的 P 值。若报告这些 P 值,请说明它们未进行多重比较校正。