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要在 Prism 中选择剂量-反应模型,您需要回答以下四个问题:

X 值是浓度(或剂量)还是浓度或剂量的对数?

Prism为剂量反应曲线提供了两组方程。一组假设X是剂量或浓度的对数,另一组假设X是剂量或浓度本身。请务必选择与数据相符的方程。

是兴奋还是抑制?

Prism 提供了一组用于兴奋作用的剂量反应方程,以及另一组用于抑制作用的方程。抑制方程的曲线呈下降趋势。两者的唯一区别在于:抑制方程拟合 IC50(“I”代表抑制),而兴奋方程拟合 EC50(“E”代表有效)。

如果曲线呈上升趋势,请从刺激方程组中选择;如果曲线呈下降趋势,请从抑制方程组中选择。

标准斜率还是可变斜率?

Prism 提供了采用标准斜率的方程(其 Hill斜率为 1.00(用于兴奋)或 -1.00(用于抑制)),以及采用可变斜率的方程(由 Prism 进行拟合)。 名称中未包含“可变斜率”的方程默认采用标准斜率。在测量配体与受体的结合时,若不存在异质性或协同作用,通常预期会出现标准斜率。但事实证明,许多其他对数剂量(log(dose))与剂量反应曲线也具有相同的标准斜率。

如果您的数据中有多于几个浓度点对应的响应值介于10%至90%之间,则可要求Prism拟合斜率。如果您的数据仅提供一两个浓度点且其响应值介于10%至90%之间,则数据实际上无法提供定义斜率的信息,您可能需要选择一个具有固定斜率的模型。

这一选择并非简单明了,在许多情况下,哪种方法更优并不明确。

是否进行标准化?

如果您的数据已经过归一化处理,使得曲线范围从 Y=0 到 Y=100,您可能希望选择归一化模型。这类模型不会拟合底端和顶端的平台区,而是强制将底端平台设为 0,顶端平台设为 100。仅当您已非常精确地确定了定义 0 和 100 的数值时,才应选择“归一化响应”方程。 数据经过归一化处理,并不意味着必须以这种方式约束曲线。

在许多情况下,是否使用归一化模型并不明确,这并非总是显而易见的决定。

特殊剂量 - 反应模型

Prism 提供了两组用于特殊剂量-反应情境的特殊模型。一组设计为接受以浓度值形式输入的 X,另一组设计为接受以 log(浓度) 值形式输入的 X:

剂量-反应 -- 特殊(X 为浓度)

方程:不对称(五参数)

方程:双相剂量-响应

方程:钟形剂量-响应

方程:操作模型-耗竭

方程:操作模型-部分激动剂

方程:Gaddum/Schild EC50 位移

方程:变构 EC50 位移

方程:ECanything

方程:EC50 位移

方程:绝对 IC50

剂量-反应 -- 特殊(X 为 Log[浓度])

方程:不对称(五参数)

方程:双相剂量-响应

方程:钟形剂量-响应

方程:操作模型-耗竭

方程:操作模型-部分激动剂

方程:Gaddum/Schild EC50 位移

方程:变构 EC50 位移

方程:ECanything

方程:EC50 位移

方程:绝对 IC50